302 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
バレーオークにおける繰り返される干魃ストレスは、特定の遺伝子近傍のトランスポゾンへのCHHメチル化を動員するが、これは局所的なトランスポゾンの抑制を維持しつつストレス応答性の遺伝子活性化を可能にするメカニズムであるものの、過剰なメチル化は最終的に転写応答を制約する。
この研究は、毒を持つヤドクガエルにおけるアルカロイド蓄積の進化が、リガンド結合セリンプロテアーゼ阻害剤（serpin）遺伝子の多様化と、輸送および代謝遺伝子の発現における協調的な変化によって駆動されていることを明らかにしている。
本研究は、20の野生脊椎動物個体群における91の効果量を対象とした世界的なメタ解析を提示しており、ゲノムの近交弱勢が（特にオスにおいて）適応度を著しく低下させること、そしてこれらのコストがライフステージ、形質タイプ、および保全状況を問わず一貫していることを裏付けている。
本研究は、クモの毒腺が、空間的座標を確立する肢のパターニング遺伝子（*Distal-less*）、分泌細胞としてのアイデンティティを維持するために潜在的な神経プログラムを抑制する転写因子（*sage*）、そして筋肉による代謝支援を駆動する筋形成因子（*sum-1*）という、3つの祖先的プログラムの階層的な共用を通じて、発生学的なキメラとして進化したことを明らかにしており、それによって複雑な器官がいかにして異なる組織モジュールを統合することで生じるかを例証している。
本研究は、野生および栽培の両方のリンゴにおいて、強い浄化選択によって駆動される保存された転写的可塑性が気候変動に対する主要な分子応答を構成している一方で、局所適応は個別の集団特異的な遺伝子座に依存しており、二次的な役割を果たしていることを示している。
本研究は、進化ゲーム理論的モデリングを通じて、個体間の異質性と創発的なリーダーシップの相互作用が、特に少数の個体が自身の強さや役割に基づいた条件付き戦略を採用する場合において、集団内における協力の進化を著しく促進することを実証している。
1,127個の単一コピー・オーソログを用いた145種のトビムシ目の包括的な系統ゲノム解析を通じて、本研究は、デボン紀前期における古くからの急速な放射進化が持続的な系統学的不一致をもたらしたことを特定することにより、トビムシ目系統学における長年の論争を解決し、最終的にPoduromorphaが現存する4つの目の中で最も初期に分岐した系統であることを支持している。
本研究は、軟骨魚類において、LPSによって活性化されたカスパーゼ1が祖先的なGSDMA/Bタンパク質を拮抗的な断片（N241およびN288）へと切断することで、固有の殺菌活性を伴う非標準的なパイロトーシス経路を駆動することを明らかにし、それによってGSDMA-D系統の進化的な起源と二重断片による調節メカニズムを解明するものである。
本論文は、ウイルスの適応を測定するための「フィットネス・フラックス」と呼ばれる直接的な周波数に基づく手法を導入し、SARS-CoV-2が当初は急速に適応した後に減速した一方で、インフルエンザH3N2はより一定のペースを維持したことを明らかにし、両ウイルスの適応度の利得がフィッシャーの基本定理と一致しており、主にスパイクタンパク質の受容体結合ドメインにおける変異によって駆動されていることを示している。
本論文は、Cas9誘発変異の非修飾性を活用した、ホモプラシーに基づくスケーラブルな手法を導入しており、グラウンドトゥルース（正解）なしで正確な再構築を判別する上で、従来のパーシモニー・スコアよりも優れた性能を示すことで、推論された細胞系統樹の信頼性を効果的に評価できることを実証している。